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HEATag:单细胞测序样本标记新方法,低成本、跨物种、全平台兼容!

发布时间:2025-11-10

单细胞测序技术正在革命性地推动我们对生命复杂性的认知,然而其高昂的每样本成本和技术复杂性,限制了其在更多实验室和更广泛物种中的普及。尽管多重样本标记技术能有效“降本增效”,但现有的方法往往受限于表面抗原外来物种非特异朋友、寡核苷酸绘制总成本慷慨激昂或操作步骤的流程较为复杂。近日,南方海洋科学与工程广东实验室(广州)的陈凯讲解队伍在Journal of Genetics and Genomics上发表了一项创新性方法学研究,提出了一种名为HEATag的新型样本标记策略,为我们提供了一个低费用、跨动物群、全公司兼容的全新解决方案。

学术期刊简价

Journal of Genetics and Genomics (JGG)是由国内 学科探索院基因基因隔代基因遗传规律与生长发育分子结构生物制品工程学学探索所和国内 基因基因隔代基因遗传规律自学举办的世界学术交流性刊物,始终坚持打造于消息生命值学科探索和医美基因基因隔代基因遗传规律学邻域的原创内容性探索成果展。JGG 2028年度关系成分7.1,Scopus学术交流性刊物测评技术指标CiteScore 9.9,位于JCR 2028年度GENETICS & HEREDITY邻域Q1区(Top 10%),BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY邻域Q1区,位于国内 学科探索院刊物系统分区分子结构生物制品工程学学学科门类1区(Top刊物),基因基因隔代基因遗传规律学和生化学与分子结构分子结构生物制品工程学学小类双1区。

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些什么才是HEATag

幽默的“二融合”制定

HEATag是由凝集素和HUH内切酶定义的重构蛋清

「准确定位器」传感器 - 凝集素

能够识别细胞膜上广泛存在且高度保守的糖基化突显(如GlcNAc和Neu5Ac)。

「联系器」电源模块 - HUH内切酶

可以序列特异性地与普通的、无需化学修饰的单链DNA(ssDNA)数据库索引长形码对其进行共价无线连接。

“1+1>2”的效用:将两者融合,得到的HEATag蛋白既能通过凝集素牢牢锚定在细胞膜上,又能通过HUH蛋白携带特定的DNA条形码进行范本标上与追溯。

Fig1: HEATag多厚标出原里提示图

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实践检验检测

HEATag真不知道有可以打?

需要在多种条件下,实现目标喂奶甲壳动物細胞膜系单細胞膜混样测序

实验室里的设计再精妙,也要经过真实样本的 “实战考验” 才算数。科研管理团队为 HEATag 放置了多轮 “负担自测”,从生殖体细胞系到生殖体细胞,从普通到超低温,从新鲜范本到固定住范本,全坐向校验它的安稳性和稳定性。

第一点轮测试英文重要性辅乳爬行动物组织系:研究研究工人选购了来自五湖四海人、鼠、仓鼠以下三个植物植物动物群的四大组织(HEK293T、K562、MEF、CHO),在恒温下要 HEATag 标识后混合型测序。决定性收旧的 11447 个组织中,85.66% 都能使用 HEATag 长形码更准配对到原植物植物动物群,模板间交叠污染破坏非常少,UMAP 聚类研究法研究体现了一直证件,HEATag 长形码与植物植物动物群非特异聊天基因遗传组优点极高一样的。 之后,测试图片前提前提环境进那步提升:的研究相关的人员成功在 4℃下标志鲜新血神经元、在常温下标志甲醇特定血神经元,可能简单标志血神经元核。但是一样完美:各个前提前提环境下,模本商品标签与外来物种的信息均还具有有效的相关的性,拆成确切率超 95%。倘若甲醇特定会形成重度的转录本交叉的情况水污染,血神经元核准备都会有少许 RNA 因为流失,血神经元种类的参考文献标注但是一样与鲜新模本确保高度,关系证明 HEATag 会标志有差异处置前提前提环境下的科学实验模本。

Fig2: HEATag 可在的不同因素下完毕单细胞膜转录组混样分析一下

要标记图片辅乳爬行动物界和海底无脊椎骨爬行动物界的原代生殖细胞

倘若说細胞系测评是 “基础上题”,那策划 范本即是 “浮动题”, 哪些范本因此因細胞内型非常复杂、环境适用于性异常,加入标签技術的 “思路”,而 HEATag 恰恰舞在哪些 “思路” 上展露了优质。

研究团队选择了大鼠和小鼠的睾丸公司,这类样本包含精原干细胞、精母细胞、精子细胞等多种类型,对标记一致性的要求极高。实验中,两种动物的睾丸用特异性 HEATag 条形码标记后混合测序,最终获得的 14663 个细胞一方面能被更准分清,几乎所有具体组织细胞款式的聚类算法成果都流畅可辨。

更令人惊喜的是HEATag对海洋能海洋生物的支持性。HEATag能在海水的等渗溶液中标记新鲜的海洋动物细胞(如海月水母、大西洋海刺水母)。研究人员用人工海水稀释的HEATag 标记了水母和珊瑚的组织细胞后在 BD Rhapsody 平台测序,最终回收的 6452 个细胞中,HEATag 条状码与外来物种转录组都具有较高相唯一性,没能会出现因高盐自然环境使得的 “标出已过期”。后续对甲醇固定的海洋生物细胞测试结果显示,HEATag 在固定样本中的拆分效果优于新鲜样本。

Fig3: HEATag 可建立母乳喂奶小动物机构模本各种方面 scRNA-seq 分析一下

Fig4: HEATag可改变新鲜毛肚海上无脊椎神经小动物几吨 scRNA-seq 浅析

HEATag与血细胞的运用不会轻易诱发转录组的相关系数提升

对样本标记技术来说,“不影响样本本身的 RNA 特征” 是底线。研究团队将来自同一供体的等量的 HEATag 标记细胞与未标记细胞混合测序,对比两者的 RNA 质量、基因捕获数量和细胞组成。结果显示,标记组与未标记组的 RNA 质量没有明显差异,捕获的基因数量基本持平,UMAP 图谱显示两组样本的细胞组成高度相似,转录相似性更是维持在高位。无论是细胞簇的注释结果,还是不同细胞类型的基因回收数量,两组都几乎一致,没有出现 “标记导致的基因表达异常”。这意味着,HEATag在做好标志工作任务的也,不太会对后面的转录类物质析带来抑制,确保了调查信息的真实度性。

Fig5: HEATag不太会关系样表的 RNA 体现经营模式

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未来的发展可期

HEATag 能为单上皮细胞学习受到哪些?

HEATag 的价格,远不是于 “缓解标签情况”,它的具备灵活力性高性和普遍意义,正在慢慢为单神经细胞论述使用 越来越多必要条件性

从应运景象方面看

HEATag 能覆盖住从 “简略特别数据分析”(如癌机构与普通机构、肿瘤药物解决与比较)到 “大的规模性的探究”(如机构上皮体细胞图谱画制、高通骁龙量挑选)的全条件要求。近年来 PIP-seq、Stereo-cell 等创新可延伸技術的发展进步,HEATag 还能进那步升高单上皮体细胞的探究的通量,动力成果转化拜谱生物大力开展大些的规模性的顶目。

从跨邻域成长性看你

HEATag 不但适适合用转录组学,还能与表观人类基因组学、蛋清质组学、房间组学等技巧水平切合,凭借私人定制引索和寡核苷酸编码序列,HEATag 行更快溶入区别的组学程序,不影响到数据猎取强度。互相,立于HEATag还行经济发展单细胞膜糖组学探索技巧水平。

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合伙静态

拜谱生物学与陈凯先生促成教学过程进行合作合作协议

划得来关注度的是,在 HEATag 技術浮出现强大技术应用软件成长性的蓝本下,拜谱海洋资源动物技艺已与南方城市海域地理学与工程建设全国论述室(广州市)陈凯专家确立进行合作方式购房意向。夫妻之间预计紧紧围绕 HEATag 技術的工业化正式出台、科技生成等走向开展进一步协同,推向这些低的成本、跨鱼类的单癌細胞系标记图片技術更好技术应用软件于实际的科技消费场景,为其他论述室展示极有效率、经济发展的单癌細胞系论述的工具,推助科技事情者在癌細胞系海洋资源动物技艺学、海域海洋资源动物技艺学、病症逻辑等的领域提供其他达到
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